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[文献快讯] 保存剂和温度对循环肿瘤DNA分析的影响

2017-12-18 00:00来源:原版作者:S Parpart-Li .et al.

文章出处:《Clinical Cancer Research An Official Journal of the American Association for Cancer Research, 2017 , 23 (10) :2471

文章导读:

目的:游离DNA(cfDNA)基因组改变的分析正在发展,作为检测,监测和基因型恶性肿瘤的一种方法。从循环肿瘤DNA(ctDNA)分析的全血细胞部分分离液体的方法已经在很大程度上未被研究,尽管这些可能是测定性能的关键考虑因素。

实验设计:为了评估血液处理对cfDNA和ctDNA质量和产量的影响,我们比较血清中的cfDNA水平和血浆中的cfDNA水平。考虑到血清ctDNA分析的局限性,我们评估了两种血浆处理方法K 2 EDTA和游离DNA BCT(BCT)试管对cfDNA和ctDNA回收的影响。在两种管类型中收集来自9名患有癌症的患者的45个样品。一旦收集,立即将血液加工成血浆或保持在室温下,并在1,3,5或7天时加工成血浆。

结果:早在收集后24小时,从收集在K 2 EDTA管中的血液中分离的血浆含有随时间增加的cfDNA水平升高,与BCT管相比没有观察到cfDNA水平显着增加。当另外6例癌症患者以相同方式采集的样本在3天的过程中在4℃储存在K 2 EDTA管中时,在BCT管中收集的样品的总cfDNA和ctDNA水平相当。在第3天,在两个试管中ctDNA水平有降低的趋势,当在K 2 EDTA管中在4℃下储存的情况下测量突变等位基因级分时,其更显着。

结论:总之,血液处理的方法对cfDNA和ctDNA水平有很大的影响,在评价外周循环中的ctDNA时应该考虑到这一点。

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