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[文献快讯] 优化预分析方法改善非小细胞肺癌(NSCLC)患者循环肿瘤DNA(ctDNA)中的KRAS突变检测

2017-12-18 00:00来源:原版作者:JL Sherwood.et al.

文章出处:《Plos One , 2016 , 11 (2) :e0150197

文章导读:

介绍:使用循环肿瘤DNActDNA)的非侵入性突变检测是有吸引力的前提。这可以使没有肿瘤样本的患者获得更多的治疗选择。

材料和方法:从45NSCLC患者分析外周血和匹配的肿瘤。我们调查了预分析变量对DNA产量和/KRAS突变检测的影响:样品收集管类型,温育时间,离心步骤,血浆输入体积和DNA提取试剂盒。

结果:2小时的孵育时间和双倍血浆离心(2000xg)降低总体DNA产量,导致污染的基因组DNAgDNA)水平降低。抽血后72小时,与EDTA管相比,使用无细胞DNA血液采集管(cfDNA BCT)观察到减少的污染和增加的KRAS突变检测。血浆输入量和使用不同的DNA提取试剂盒影响DNA产量。

结论:这项研究表明,NSCLC突变检测成功的ctDNA恢复取决于预分析步骤。建议开发从ctDNA样本检测KRAS突变的标准方法,以尽量减少预分析步骤对突变检测率的影响。在不能快速进行样品处理的地方,使用cfDNA BCT管将是有利的。

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